現在、自社アフィリエイト構築モジュールの次期バージョンを開発中です。
リリースが、遅れてしまっているので、実装予定の機能だけでもご報告いたします。

バグフィックス
・無料商品の広告バナーでFree画像が表示されないバグ
・アフィリエイト報酬・支払い管理画面の編集・削除ができないバグ(PHP5の場合) 参考URL

新機能
・商品/カテゴリ用の広告HTMLを有効/無効の切り替え可能に
・商品画像の表示方式を変更
・新規アカウント作成による固定報酬
・上記のアカウントによる注文は、一定期間報酬の対象に
・「報酬確定：注文からの日数」の設定を「月末締め」や「毎月○○日締め」に設定できるように
・下位階層のユーザ数を確認できるように

なお、新機能に関しては、検討中のものもあり、すべてが実装されるとは限りません。